在演出曲目安排方面，“贝多芬大全”系列将贯穿整个音乐季，乐圣的九部交响曲、七部大型协奏曲以及重要的序曲作品将悉数登台，此外还包括《合唱幻想曲》、《平静的海和幸福的航行》等较为冷僻的曲目，贝多芬乐迷们可大饱耳福。名字出现频率次高的作曲家是勃拉姆斯，其《D大调小提琴协奏曲》、《G小调第一钢琴四重奏[管弦乐版]》、《海顿主题变奏曲》、《德意志安魂曲》、《降B大调第二钢琴协奏曲》等重量级作品将逐一登台。当然，2013年是“威尔第年”和“瓦格纳年”，乐团也计划以对应的纪念音乐会表达对两位歌剧大师的敬意；此外，还有数台高质量的室内乐演出，有年度驻团艺术家王晓东和上海四重奏鼎立加盟，曲目也很具吸引力。
具体的乐季音乐会安排如下：
●2012-13音乐季开幕音乐会
2012/9/7 上海东方艺术中心
指挥-余隆；独奏-王晓东
曲目-勃拉姆斯《D大调小提琴协奏曲》[作品77]、《G小调第一钢琴四重奏》[作品22，管弦乐版，勋伯格配器]
●艾丽森·巴尔松演绎海顿
2012/9/27 上海音乐厅
指挥-路易·朗格雷；独奏-艾丽森·巴尔松
曲目-勃拉姆斯《海顿主题变奏曲》[作品56a]；海顿《降E大调小号协奏曲》[Hob.VIIe/1]；弗朗克《D小调交响曲》
●贝多芬大全：5+5
2012/10/6 上海音乐厅
指挥-约翰内斯·韦尔德纳；独奏-齐蒙·巴托
曲目-贝多芬《C小调第五交响曲》[作品67]、《降E大调第五钢琴协奏曲“皇帝”》[作品73]
●朱践耳先生室内乐作品专场
2012/10/18 上海东方艺术中心演奏厅
演奏者-待定
曲目-待定
●德意志安魂曲
2012/10/27 上海东方艺术中心
指挥-罗尔夫·贝克；独唱-安妮卡·索菲·瑞特列夫斯基[女高音]、麦克·库普费尔[男中音]
曲目-勃拉姆斯《德意志安魂曲》[作品45]
●廖昌永和他的朋友们
2012/11/4 上海东方艺术中心
指挥-待定；独唱-廖昌永、石倚洁、毛阿敏
曲目-待定
●贝多芬大全：1+1
2012/11/17 上海音乐厅
指挥-陈燮阳；独奏-韩闻放
曲目-贝多芬《科里奥兰序曲》[作品62]、《C大调第一钢琴协奏曲》[作品15]、《C大调第一交响曲》[作品21]
●贝多芬大全：3+3
2012/11/23 上海东方艺术中心
指挥-许忠；独奏-乔恩·木村·帕克
曲目-贝多芬《C小调第三钢琴协奏曲》[作品37]、《降E大调第三交响曲“英雄”》[作品55]
●上海四重奏室内乐音乐会-I
2012/11/28 上海东方艺术中心演奏厅
演奏者-上海四重奏
曲目-巴托克《弦乐四重奏》
●贝多芬大全：田园贝多芬
2012/12/1 上海音乐厅
指挥-安东尼·维特；独奏-王晓东
曲目-贝多芬《D大调小提琴协奏曲》[作品61]、《F大调第六交响曲》[作品68]
●王晓东和上海交响乐团成员室内音乐会-I
2012/12/5 上海东方艺术中心演奏厅
演奏者-王晓东与上海交响乐团成员
曲目-理查·施特劳斯《变形记》[弦乐七重奏版]；勃拉姆斯《降B大调第一弦乐六重奏》[作品18]
●安乐乡·逝去的时光
2012/12/12 上海音乐厅
指挥-余隆；独奏-秦立巍
曲目-埃尔加《“安乐乡”序曲》[作品40]；陈其钢《逝去的时光》；海顿《D大调第104号交响曲“伦敦”》
●奥斯莫·万斯卡演绎西贝柳斯
2012/12/22 上海音乐厅
指挥-奥斯莫·万斯卡；独奏-唐韵
曲目-西贝柳斯《芬兰颂》[作品26]、《E小调第一交响曲》[作品39]、尼尔森《小提琴协奏曲》[作品33]
●2013上海新年音乐会
2012/12/31 上海东方艺术中心
指挥-待定
曲目-待定
●格里莫演绎勃拉姆斯
2013/1/5 上海音乐厅
指挥-张洁敏；独奏-埃莲娜·格里莫
曲目-勃拉姆斯《A大调第二小夜曲》[作品16]、《降B大调第二钢琴协奏曲》[作品83]
●贝多芬大全：4+4
2013/1/19 上海音乐厅
指挥-吕嘉；独奏-张昊辰
曲目-贝多芬《降B大调第四交响曲》[作品60]、《G大调第四钢琴协奏曲》[作品58]
●斯蒂凡·马尔祖首度访华音乐会
2013/2/3 上海音乐厅
指挥-斯蒂凡·马尔祖；独奏-王健[大提琴]、黄铮[双簧管]
曲目-舒伯特《B小调第八交响曲“未完成”》[D759]；陈其钢《双簧管协奏曲“道情”》；布洛赫《所罗门》；德彪西《大海》
●音乐会版经典歌剧《弄臣》
2013/2/24 上海东方艺术中心
指挥-张洁敏；演唱-待定
曲目-威尔第《弄臣》[音乐会版歌剧]
●贝多芬大全：2+2
2013/3/2 上海音乐厅
指挥-杨洋；独奏-大卫·弗雷
曲目-贝多芬《莱奥诺拉第二序曲》[作品72a]、《降B大调第二钢琴协奏曲》[作品19]、《D大调第二交响曲》[作品36]
●萨宾·梅耶演绎韦伯
2013/3/15 上海音乐厅
指挥-大植英次；独奏-萨宾·梅耶
曲目-韦伯《魔弹射手序曲》、《F小调第一单簧管协奏曲》[作品73]、《降E大调单簧管小协奏曲》[作品26]、《邀舞》[作品65，柏辽兹配器]
●康姆罗西演唱威尔第——纪念威尔第诞辰200周年
2013/3/31 上海音乐厅
指挥-余隆；独唱-伊迪科·康姆罗茜[次女高音]
曲目-威尔第歌剧经典咏叹调选
●瓦格纳集锦——纪念瓦格纳诞辰200周年
2013/4/5 上海音乐厅
指挥-大卫·斯特恩；独唱-盖伊·曼海姆[男高音]、伊迪特·扎米尔[女高音]
曲目-瓦格纳歌剧《黎恩济》、《罗恩格林》、《帕西法尔》、《女武神》选段
●双雄会I——余隆和迪克特洛夫演绎德奥经典
2013/4/13 上海音乐厅
指挥-余隆；独奏-格兰·迪克特洛夫
曲目-贝多芬《莱奥诺拉第三序曲》[作品72b]；布鲁赫《G小调第一小提琴协奏曲》[作品26]；门德尔松《A大调第四交响曲“意大利”》[作品90]
●贝多芬大全：三重协奏曲
2013/4/20 上海音乐厅
指挥-张国勇；独奏-王晓东[小提琴]、李坚[钢琴]、黄北星[大提琴]
曲目-贝多芬《C大调三重协奏曲》[作品56]、《A大调第七交响曲》[作品92]
●王晓东和上海交响乐团成员室内乐音乐会-II
2013/4/21 上海东方艺术中心演奏厅
演奏者-王晓东与上海交响乐团成员
曲目-贝多芬《降E大调弦乐三重奏》[作品3]；舒伯特《F大调八重奏》[D803]
●贝多芬大全：雅斯普契克演绎“欢乐颂”
2013/5/4 上海东方艺术中心
指挥-雅切克·卡斯普契克；独奏-解静娴
曲目-贝多芬《合唱幻想曲》[作品80]、《D小调第九交响曲“合唱”》[作品125]
●双雄会II——麦斯基和西特科维茨基演绎肖斯塔科维奇
2013/5/19 上海音乐厅
指挥-迪米特里·西特科维茨基；独奏-米沙·麦斯基
曲目-肖斯塔科维奇《降E大调第一大提琴协奏曲》[作品107]、《D小调第五交响曲》[作品47]、柴可夫斯基《伦斯基的咏叹调》[选自歌剧《叶甫根尼·奥涅金》]
●上海四重奏室内乐音乐会-II
2013/5/24 上海东方艺术中心演奏厅
演奏者-上海四重奏
曲目-待定
●德波拉·弗格特演唱美国歌曲集
2013/5/31 上海东方艺术中心
指挥-泰德·斯佩林；独唱-德波拉·弗格特[女高音]
曲目-《香草冰淇淋》[选自杰瑞·伯克《她爱我》]，《失去理智》[选自斯蒂芬·桑德海姆《富丽秀》]，《不可救药地爱上我的男人》[选自科恩/汉默斯坦《演艺船》]以及《窈窕淑女》、《音乐之声》等剧的经典唱段
●爱
2013/6/7 上海东方艺术中心
指挥-谭盾；独奏-姚珏
曲目-莫扎特《女人心序曲》；谭盾《小提琴协奏曲“爱”》；普罗科菲耶夫《罗密欧与朱丽叶》选段
●贝多芬大全：平静的海和幸福的航行
2013/6/13 上海东方艺术中心
指挥、独奏-林昭亮
曲目-贝多芬《平静的海和幸福的航行》[作品112]、《G大调第一小提琴浪漫曲》[作品40]、《F大调第二小提琴浪漫曲》[作品50]、《F大调第八交响曲》[作品93]
●圣-桑管风琴交响曲音乐会
2013/6/22 上海东方艺术中心
指挥-雅隆·特劳布；独奏-徐惟聆[小提琴]
曲目-圣-桑《C大调第二小提琴协奏曲》[作品58]、《C小调第三交响曲“管风琴”》[作品78]
●上海交响乐团2012-13音乐季闭幕演出暨2013上海夏季音乐节开幕演出
2013/7/6~7
指挥-余隆
曲目-待定